开源医学 AI 框架 MONAI

昨日,英伟达与伦敦国王学院发布开源医学 AI 框架 MONAI。该框架使用 PyTorch 深度学习框架,并使用了分布式内存计算平台 Ignite。基于 NVIDIA Clara,NiftyNet,DLTK and DeepNeuro 等库。旨在提供一种开源、标准化程度高、用户友好、可复现性好、易于集成、高质量的针对医疗领域特定优化的深度学习框架,方便处理不同格式、不同分辨率、元数据的医学图像。其中算法的可重复性是设计该框架重点考虑的问题。

在目前的第一个发布版中已经囊括了特定领域数据转换、神经网络架构、和一些模型评估方法。已包含数据处理、2D 图像分类、3D 图像分割等目前在业界表现[……]

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UC 圣地亚哥大学开源新冠肺炎 CT 数据集

截至 2020 年 3 月 30 日,在全世界范围内已有 775,306 人感染新冠肺炎,37,083 人死亡。对此疾病检测的低效和缺乏成为控制其传播的主要障碍。目前的检测主要基于逆转录聚合酶链反应(RT-PCR),需要 4 到 6 个小时才能获得结果。与新冠肺炎可怕的传播速度相比,这远不够快。除了效率低下之外,RT-PCR 检测试剂盒也非常短缺。

这促使研究团队去研究替代的检测方式。这些方式可能更快,比 RT-PCR 便宜,更容易获得,但与 RT-PCR 一样准确。在众多可能性中,研究团队对 CT 图像尤其感兴趣。有几篇著作研究了 CT 图像在筛选和检测新冠肺炎时的效果,结果鼓舞人心。[……]

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DeepLesion:最大开源临床医疗图像数据集

NIH 临床中心最新公布了一个迄今规模最大的多类别、病灶级别标注临床医疗 CT 图像开放数据集 DeepLesion,研究人员在此基础上训练深度神经网络,创建了一个具有统一框架的大规模通用病灶检测器,能够更准确、更自动地衡量患者体内所有病灶的大小,实现全身范围的癌症初步评估。数据集包含:

  • 4,427 名独立的匿名患者
  • 10,594 次 CT 扫描(平均每位患者有 3 次随访)
  • 32,735 个带标记的病灶实例
  • 一共 928,020 张 CT 横切图像(512×512 分辨率)

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上海交通大学《2019 中国人工智能医疗白皮书》发布

AI 读片快准稳,微缩机器人“助手”深入人体直捣病灶——人工智能与医疗领域的结合,会不会将更多疾病预防在前,或者让普通人看病更容易?日前,上海交通大学人工智能研究院联合上海市卫生和健康发展研究中心、上海交通大学医学院发布了《人工智能医疗白皮书》 。该白皮书包含人工智能医疗发展历史、政策分析、行业现状、面临的挑战及趋势分析四大部分,全面分析了世界主要国家人工智能医疗研究的热门领域、面临的主要挑战和未来发展趋势,为我国人工智能医疗行业的政策制定、学术发展、投资策略、产品应用等提供了智力支持和政策依据。

近年来,在国家政策的支持与驱动下,在互联网、大数据、人工智能等前沿技术的支撑下,我国智慧医[……]

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新型冠状病毒肺炎 (COVID-19) 数据集汇总

『山川异域,风月同天』—— 新冠肺炎疫情牵动着举国上下的心,包括跨象乘云™ 在内,众多高科技企业除了向灾区捐赠物资,配合疫情防控工作,延期复工 / 远程办公的同时,也在积极探索如何利用大数据、新一代人工智能等新技术为『战疫』助力。

此前,跨象乘云™ 发布了多份新型冠状病毒肺炎(COVID-19)相关的数据集。随着关于新型冠状病毒病毒疫情的不断发展,有关疫情的各类信息和数据也在不断更新。结合日前『图灵公众号』(微信公众号:TOPIA)整理的新冠数据集,在这里作一个阶段性汇总。

  1. 微软、白宫发布的 COVID-19 开放研究数据集(COVID-19 Open Research Dat[……]

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新型冠状病毒肺炎开源项目

『山川异域,风月同天』—— 新冠肺炎疫情牵动着举国上下的心,包括跨象乘云™ 在内,众多高科技企业除了向灾区捐赠物资,配合疫情防控工作,延期复工 / 远程办公的同时,也在积极探索如何利用大数据、新一代人工智能等新技术为『战疫』助力。

其中,针对 2020 年初在武汉爆发的新型冠状病毒疫情,新型冠状病毒防疫信息收集平台项目,旨在收集各医院、酒店、工厂、物流、捐赠、捐款、预防、治疗、动态等信息,统一收集,统一发布,以便各方之间进行信息互通,有效调配社会资源。

另外,除了 2019-nCoV 的现状和如何防护是我们关注的重点,这个疫情的起源也是一个关注点,2019-nCoV 时间线项目,记[……]

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胸部放射影像数据集:CheXpert

在这次新冠肺炎『战疫』中,面向医疗医学的深度学习与新一代人工智能科研攻关越显重要。如:在 Keras 中通过递归神经网络(RNN)为时间序列数据建模;使用 MedNIST 数据集进行医学图像分类;应用深度学习数据科学工作流在医疗领域;使用 DIGITS 实现医学影像分割;使用 TensorFlow 实现图像分类;使用 R 和 MXNet 实现医学影像分析;使用 GAN 对医学图像进行数据集扩展与图像分割;将由粗到细的上下文记忆应用于医学影像 …… 都是非常热门的研究方向。

其中,胸部放射影像是全球最常见的影像检查,对很多威胁终身的疾病的筛查、诊断和治疗至关重要。在论文《CheXpert:[……]

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英特尔 AI 医疗实战手册

AI 正在变革(中国)医疗。最近,Intel 一份实战手册刚刚披露,清晰勾勒出了 AI 如何重塑着医疗行业的各个方面。而且,这份手册展示的不光有趋势分析、技术规划,还展示了诸多案例,是实践实战后的全面总结。报告撰写者,正是提供了最基础但覆盖全流程的 AI 能力计算巨头英特尔,可以说是 AI 医疗的首份权威“剑谱”。[……]

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IBM 开源三个抗癌 AI 项目

项目地址:

https://www.techzine.be/nieuws/41092/ibm-maakt-drie-ai-projecten-gericht-op-kankeronderzoek-opensource.html

近日,IBM 向开源社区发布了三个旨在克服治愈癌症的 AI 项目。在本月晚些时候将在瑞士举行的第 18 届欧洲计算生物学大会(ECCB)和第 27 届分子生物学智能系统大会(ISMB)上,将会深入介绍PaccMann 项目。

2018 年,癌症导致全球 960 万人死亡,此外,同年增加了 1800 多万新的癌症病例。IBM 计算系统生物学小组的研究人员[……]

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